Gegenüber der aus dem Jahre 1990 veröffentlichten Liste haben sich hinsichtlich der Gefährdungsstufen einige Änderungen ergeben, außerdem wurde verstärkt auf die Regionalisierung zwischen Bayern Nord (Einzugsgebiet Main, Elbe) und Süd (Einzugsgebiet Donau. Bodensee) geachtet. ein F in den Gefährdungsdaten heißt, dass der Fisch in der Region nicht natürlicherweise nicht vorkommt, außerdem kann es regional unterschiedliche Gefährdungsgrade geben
| Wissensch. Artname | Deutscher Artmane | Nord | Süd |
| Salmo Salar LINNE | Atlantischer Lachs | 0 | F |
| Alosa fallax LACÉPÈDE | Finte | 0 | F |
| Lampetra fluviatilis LINNE | Flussneunauge | 0 | 1 |
| Alosa alose LINNE | Maifisch | 0 | 1 |
| Petromycon marinus LINNE | Meerneunauge | 0 | F |
| Salmo trutta trutta LINNE | Meerforelle | 0 | F |
| Acipenser sturio LINNE | Stör | 0 | 0 |
| Wissensch. Artname | Deutscher Artmane | Nord | Süd |
| Lampetra planeri BLOCH | Bachneunauge | 3 | 1 |
| Eudontomycon vladikovi OLLIVA&ZANANDREA | Donauneunauge | F | 1 |
| Rutilus meidingeri HECKEL | Perlfisch | F | 1 |
| Teleste cultratus LINNE | Sichling | F | 1 |
| Cobitis taenia LINNE | Steinbeißer | 1 | 1 |
| Rheogobio uranoscopus AGASSIZ | Steingressling | F | 1 |
| Acipenser ruthenus LINNE | Sterlet | F | 1 |
| Leuciscus souffia RISSO | Strömer | 1 | 1 |
| Wissensch. Artname | Deutscher Artmane |
Nord
|
Süd
|
| Thymallus thymallus LINNE | Äsche |
3
|
2
|
| Rhodeus amarus BLOCH | Bitterling |
2
|
2
|
| Coregonus pidschian GMELIN | Kilch |
F
|
2
|
| Chondrostoma nasus LINNE | Nase |
2
|
2
|
| Lota lota LINNE | Rutte |
2
|
2
|
| Coregonus arenicolus KOTTELAT | Sandfelchen |
F
|
2
|
| Misgurnus fossilis LINNE | Schlammpeitzger |
2
|
2
|
| Alburnoides bipunctatus BLOCH | Schneider |
2
|
3
|
| Gymnocephalus schraetser LINNE | Schrätzer |
F
|
2
|
| Salmo trutta LINNE | Seeforelle |
F
|
2
|
| Zingel streber SIEBOLD | Streber |
F
|
2
|
| Rheogobio vladykovi FANG | Weißflossiger Gründling |
F
|
2
|
| Zingel zingel LINNE | Zingel |
F
|
2
|
| Wissensch. Artname | Deutscher Artmane |
Nord
|
Süd
|
| Anguilla anguilla LINNE | Aal |
3
|
F
|
| Barbus barbus LINNE | Barbe |
3
|
3
|
| Phoxinus phoxinus LINNE | Elritze |
3
|
3
|
| Rutilus pigus ECKEL | Frauennerfling |
F
|
3
|
| Hucho hucho LINNE | Huchen |
F
|
3
|
| Chalcalburnus chalcoides GÜLDENSTÄDT | Mairenke |
F
|
3
|
| Leucaspius delineatus HECKEL | Moderlieschen |
3
|
V
|
| Leuciscus idus LINNE | Nerfling |
3
|
V
|
| Aspius aspius LINNE | Schied |
V
|
3
|
| Cyprinus carpio LINNE | Wildkarpfen |
V
|
3
|
| Abramis sapa PALLAS | Zubel |
F
|
3
|
| Abramis ballerus LINNE | Zope |
F
|
3
|
| Wissensch. Artname | Deutscher Artmane |
Nord
|
Süd
|
| Salvelinus monostichus Heckel | Seesaibling |
F
|
R
|
| Pungitius pungitius LINNE | Zwergstichling |
R
|
R
|
| Wissensch. Artname | Deutscher Artmane |
Nord
|
Süd
|
| Salmo trutta LINNE | Bachforelle |
V
|
V
|
| Barbatula barbatula LINNE | Bartgrundel |
V
|
V
|
| Coregonus wartmanni BLOCH | Blaufelchen |
F
|
V
|
| Gasterosteus aculeatus LINNE | Dreistachliger Stichling |
V
|
|
| Coregonus macrophtalmus NÜSSLIN | Gangfisch |
F
|
V
|
| Gobio gobio LINNE | Gründling |
V
|
|
| Leuciscus leuciscus LINNE | Hasel |
V
|
|
| Carassius carassius LINNE | Karausche |
V
|
V
|
| Gymnocephalus cernus LINNE | Kaulbarsch |
V
|
|
| Neogobius kessleri GÜNTHER | Kessler Grundel |
F
|
V
|
| Alburnus alburnus LINNE | Laube |
V
|
|
| Proterorhinus marmoratus PALLAS | Marmorierte Grundel |
F
|
V
|
| Cottus gobio LINNE | Mühlkoppe |
V
|
V
|
| Vimba vimba elongata LINNE | Seerüßling |
F
|
V
|
| Salvelinus umbla LINNE | Seesaibling |
F
|
V
|
| Silurus glanis LINNE | Wels |
V
|
|
| Vimba vimba LINNE | Zährte |
F
|
V
|
| Wissensch. Artname | Deutscher Artmane |
Nord
|
Süd
|
| Gymnocephalus baloni HOLCIK&HENSEL | Donaukaulbarsch |
F
|
D
|
| Rheogobio kessleri DYBOWSKI | Kessler-Gründling |
F
|
D
|
| Coregonus bavaricus HOFER | Kilch, Bodensee |
F
|
D
|
| Coregonus gutturosus Gmelin | Kilch, Ammersee |
F
|
D
|
| Salvelinus profundus SCHILLINGER | Tiefsee-Saibling |
F
|
D
|
